در متن حکم رییس جمهور خطاب به دکتر طیبی آمده است: «در اجرای بند 7 اساسنامه جهاد دانشگاهی و بر اساس مصوبه 737 مورخ 92/7/23 شورای عالی انقلاب فرهنگی به موجب این حکم به مدت سه سال به عنوان رییس جهاد دانشگاهی انتخاب می‌شوید.
امید است با عنایت الهی در خدمت به ملت شریف ایران و نظام جمهوری اسلامی و رعایت اصول قانونمداری ، اعتدال‌گرایی و منشور اخلاقی دولت تدبیر و امید موفق باشید.»
دکتر طیبی که با کسب 8 رای از 9 رای ماخوذه اعضای هیات امنای جهاد دانشگاهی از میان نامزدهای معرفی شده شامل دکتر طیبی، دکتر یادگاری، دکتر منتظری، دکتر ایمانی خوشخو و دکتر شمسیان، به عنوان گزینه نهایی انتخاب شده بود، در جلسه شامگاه سه‌شنبه گذشته شورای عالی انقلاب فرهنگی نیز با کسب اکثریت آرا به عنوان رییس جهاد دانشگاهی معرفی و جایگزین دکتر یادگاری شد.
دکتر طیبی پیش از این یک دوره ریاست جهاد دانشگاهی را بر عهده داشته و پیش از دوره جدید ریاست جهاد دانشگاهی، ریاست جهاد دانشگاهی علم و صنعت را نیز بر عهده داشت.